色999故事发生在一家精神疾病疗养院中——梶木秀丸（笑福亭鹤瓶 饰）曾经因为杀害了母亲和妻子而被判处了死刑，却奇迹般的在行刑的过程中死里逃生、阿中（绫野刚 饰）曾经是平凡的上班族，却因为日益严重的幻听而遭人歧视，最终丢掉了工作人生一败涂地、由纪（小松菜奈 饰）身为女子高中生，却强烈的抗拒去学校，整天把自己关在房间里做家里蹲，最终被忍无可忍的父母送进了疗养院。