善良的女秘书取材于抗日战争时期中国军民协力以军犬为武器抗击日本侵略者的史实。地下党员关汉良为寻访良犬乔装来到武平山中村落。关与日军官八木皆发现二林的狗海龙是罕见的优秀狼犬。海龙为救主人不幸身亡，其幼犬大龙和小龙加入了关的军犬突击队。经过一年的强化训练，它们成为了军犬队的头犬。八木率军疯狂进攻游击队及附近的村庄，大龙赶回军犬训练基地后牺牲，小龙将八木引至海龙的墓前，以自己的方式报了仇。