色999講述一個普通人何俊傑（林保怡）的婚後生活。俊傑對于自己事業成功的太太袁天蘭（藍潔瑛）的感覺是又敬又怕。一次天蘭去澳洲公幹，俊傑意外把表妹許安琪（郭靄明）帶回家，從此麻煩不斷。俊傑終于無法忍受，決定把安琪送走，但突然被她深深吸引。俊傑壓抑自己的感情，并決定拒絕安琪的愛。同時安琪發現自己實際上是叫做袁天蘭，于是決定去加拿大尋找事情真相。 當真正的天蘭回到香港，俊傑發現她竟然與合夥人鍾瑞良（洪朝豐）有染。爲了報複，俊傑開始接近瑞良的妻子張佩兒（楊雪儀），二人日久生情。但瑞良和佩兒突然同時身亡，令俊傑成爲疑兇。在警探梁志滔(歐陽震華)的幫助下才恢複清白。誰知一波未平，一波又起......令俊傑震驚的是，突然傳來天蘭的死訊，同時自己又繼承了一大筆财産。 此時，俊傑遇到經營時裝店的林詠嘉（陳慧儀），在詠嘉的支持下，俊傑終于重新振作起來，并漸漸對詠嘉産生了好感。盡管知道詠嘉是被人派來謀殺自己并取得财産的，俊傑還是一次又一次的原諒了她。這令詠嘉非常感動，決定背叛自己的幕後指使者而跟俊傑在一起。在他們結婚當天，安琪突然出現阻止，并聲稱天蘭并沒有死，俊傑從而發現天蘭的真正身份......